GT LEGO

LEGO est un groupe de travail rattaché au GDR BIM du CNRS et dédié au machine learning pour la génomique.

Comme de nombreux domaines scientifiques, la génomique bénéficie de la montée en puissance qu’a connue le machine learning au cours de la dernière décennie. La communauté française de recherche en machine learning pour la génomique est active mais dispersée sur le territoire au sein d’équipes traditionnellement expertes dans d’autres domaines méthodologiques pour la génomique tels quel la statistique, l’algorithmique ou la bioinformatique.

L’objet du groupe de travail LEGO est de faciliter les échanges au sein de cette communauté, de favoriser les collaborations, et de permettre le suivi des progrès effectués par les équipes participantes.

Une première rencontre a eu lieu le 31 mai 2023 à Sorbonne Université. Cette deuxième rencontre s'inscrit dans le cadre des journées du GDR BIM, qui ont lieu tous les deux ans.

Site web: https://gt-lego.cnrs.fr

Keynotes

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Céline Brouard, chargée de recherche à l’unité MIAT, INRAE Toulouse

Titre: Graph-based deep learning approaches for phenotype prediction
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Simona Cocco, directrice de recherche au laboratoire de Physique de l’ENS Ulm.

Titre: RNA riboswiches: from evolution to design

Appel à contributions

Nous acceptons les résumés de 300 mots maximum, en français ou en anglais, décrivant des recherches en cours ou publiées récemment sur des sujets de machine learning pour la génomique.

Les membres de l’animation du GT sélectionneront un sous-ensemble des résumés soumis pour des présentations orales, et d’autres pour une présentation sous forme de posters. Les présentations auront lieu en anglais.

Les résumés sont à envoyer avant le 20 octobre 2023.

Aspects logistiques

La rencontre du GT aura lieu le jeudi 23 novembre, à la Cité Scientfique, Villeneuve d’Ascq (sur le campus de l'université de Lille).

Un déjeuner sera proposé aux personnes inscrites.

L'événement est gratuit, mais l'inscription obligatoire avant le 8 novembre 2023 pour raisons logistiques. Cette inscription se fait sur le site dédié des journées du GDR BIM : https://www.gdr-bim.cnrs.fr/journees-du-gdr-bim-2023/ qui ont lieu les 21-24 novembre.

Code de conduite

(librement adapté de NeurIPS et ICML)

Les évènements du GT LEGO visent à rassembler la communauté française de l’apprentissage automatique pour la génomique afin de favoriser un échange d’idées et un débat scientifique respectueux.

Notre objectif est que toute personne intéressée par ces évènements puisse y participer sereinement, et notamment sans subir de harcèlement ou de discrimination raciste, sexiste, homophobe, transphobe ou validiste.

L’équipe d’animation du GT se tient à la disposition des témoins ou victimes de tels incidents ou de toute autre comportement non-professionnel, et agira au mieux pour protéger leur confidentialité.

Sponsors

La rencontre est soutenue par le GDR BIM (http://www.gdr-bim.cnrs.fr) 

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Personnes connectées : 2 Vie privée
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